อำเภอท่าปลาในอดีต เป็นเขตการปกครองขึ้นอยู่กับจังหวัดน่าน โดยรวมแขวงศรีสะเกษกับแขวงท่าปลา เข้าด้วยกัน แต่เนื่องจากการติดต่อระหว่างจังหวัดน่านกับอำเภอท่าปลาไม่สะดวก เพราะระยะทางไกลมาก ในปี พ.ศ.๒๔๖๖ จึงได้โอนมาขึ้นกับจังหวัดอุตรดิตถ์ ตัวอำเภอ (เก่า)ตั้งอยู่บริเวณทางเข้าอุทยานลำน้ำน่านบ้านห้วยเจริญ หมู่ที่ ๘ ตำบลผาเลือด ในอดีตการคมนาคมติดต่อระหว่างอำเภอท่าปลากับจังหวัดอุตรดิตถ์ ติดต่อได้ ๒ ทาง คือ ทางน้ำโดยใช้เรือถ่อ ล่องลงมาตามน้ำน่าน ใช้เวลาเดินทาง ๔ วัน ทางบกใช้เวลาเดินทาง ๒ วัน ผู้ดำรงตำแหน่งนายอำเภอท่านแรกคือ ขุนศรีธานี(เลื่อน) ดำรงตำแหน่งระหว่าง ร.ศ.128 - 130